Come per quasi tutte le applicazioni Web esiste un pacchetto di sistema da installare ma di solito è obsoleto e rende difficile l'aggiunta di plugins e temi.

Per installare digitare

  sudo apt-get install dokuwiki

L'installazione manuale non è eccessivamente difficile.
Impersonando webmaster, spostarsi in /home/materiale e scaricare l'ultima versione del tgz che si trova qui. Copiate il link e sostituitelo nel comando sottostante.

su - webmaster
wget http://download.dokuwiki.org/out/dokuwiki-xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx.tgz

Decomprimere il file scaricato e settare i permessi

tar -xvf ./dokuwiki-xxxx-xx-xx.tgz -C /home/webmaster/pubblic_html/
exit
cd /home/webmaster/pubblic_html
sudo chown -R webmaster:www-data dokuwiki
sudo chmod 775 -R dokuwiki/

Puntare il browser su http://[vostro_sito]/doluwiki e terminare l'installazione.

Alla fine rimuovere il file di installazione per evitare che possa essere usato come attacco

cd dokuwiki
rm install.php

In questo caso io voto per l'installazione manuale, non comporta rischi di sicurezza e consente di avere un maggior controllo sul prodotto.